[피터페터 파트너스] 강아지 BRAF + CNA 검사 도입 안내

검사 상세 내용

반복되는 혈뇨, 빈뇨, 배뇨곤란 등 하부요로계 증상을 보이는 환자에서는 만성 염증과 종양성 질환의 감별이 쉽지 않고, 조직학적 확진이 바로 어려운 경우도 적지 않습니다. canine urothelial carcinoma(UC/TCC) 분야의 분자진단 연구들 역시 더 이른 시점의, 덜 침습적인 진단법의 필요성을 꾸준히 강조해왔습니다.

1. CNA 검사가 무엇인가요?

CNA는 copy number alteration, 즉 염색체 특정 구간의 복제수 증가(gain) 또는 감소(loss)를 확인하는 검사입니다. 강아지 UC에서는 CFA 13 gain, CFA 36 gain, CFA 19 loss가 매우 반복적으로 보고되었고, 이러한 염색체 복제수 이상은 종양성 신호를 반영하는 분자표지로 활용될 수 있습니다.

피터페터의 BRAF + CNA 검사는 BRAF V595E 변이 분석에 더해, 소변 내 탈락세포 DNA에서 이러한 복제수 이상까지 함께 평가하는 보완형 분자진단 검사입니다.

2. 왜 필요한가요?

기존 BRAF 단독 검사는 강아지 요로상피암(UC/TCC) 진단에 매우 유용합니다. 하지만 모든 환자에서 양성이 나오는 것은 아닙니다. 2015년 연구에서는 소변으로 시행한 BRAF 검사에서 전체 민감도 85%, 특이도 100%가 보고되었고, UC 환자 소변만 보면 83%에서 BRAF 변이가 확인되었습니다. 즉, 종양이 있어도 일부 환자는 BRAF 검사만으로는 음성으로 나올 수 있다는 뜻입니다. 연구진도 소변 속 종양세포가 적거나, 변이 DNA 양이 적으면 검출이 어려울 수 있다고 설명했습니다.

그래서 CNA 검사가 필요합니다.

CNA는 종양세포 DNA의 양이 정상보다 늘어나거나 줄어든 부분이 있는지를 보는 검사입니다. 쉽게 말해, BRAF처럼 한 가지 유전자 변이만 보는 것이 아니라, 종양에서 자주 반복되는 DNA 이상 패턴을 함께 확인하는 방법입니다. 2015년 연구에서는 강아지 UC에서 13번과 36번 염색체는 늘어나고, 19번 염색체는 줄어드는 변화가 매우 자주 나타난다고 보고했습니다.

이런 DNA 이상은 실제 진단 보완에도 도움이 됩니다. 2016년 연구에서는 CNA 검사를 이용해 종양 조직과 비종양 조직을 100% 민감도, 100% 특이도로 구분했고, UC 환자 소변 DNA의 67%에서도 같은 이상을 확인했습니다. 즉, BRAF만으로는 잡히지 않는 일부 환자에서도 종양성 변화를 추가로 확인할 수 있다는 의미입니다.

최근 연구도 같은 방향을 보여줍니다. 2023년 연구에서는 BRAF V595E가 검출되지 않은 소변 샘플에서도 UC에서 보이는 특징적인 CNA 패턴이 확인됐고, 그중 46%에서는 BRAF의 다른 부위나 MAP2K1 유전자 이상이 발견되었습니다. 즉, “BRAF 음성 = 종양 아님”으로 단정하면 안 되며, BRAF와 CNA를 함께 보는 것이 더 안전한 접근이라는 뜻입니다.

이 연구들을 종합하면, BRAF + CNA 검사는 BRAF 단독 검사로 놓칠 수 있는 일부 UC/TCC 의심 환자를 보완적으로 평가하기 위한 검사라고 이해하시면 됩니다.

출처

• Mochizuki H, et al. Detection of BRAF Mutation in Urine DNA as a Molecular Diagnostic for Canine Urothelial and Prostatic Carcinoma (2015)
• Shapiro SG, et al. Canine urothelial carcinoma: genomically aberrant and comparatively relevant (2015)
• Mochizuki H, et al. Detection of Copy Number Imbalance in Canine Urothelial Carcinoma With Droplet Digital Polymerase Chain Reaction (2016)
• Thomas R, et al. Whole exome sequencing analysis of canine urothelial carcinomas without BRAF V595E mutation (2023)

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